デフォルトのコマ枠ペンの設定を少しいじることで簡単に”ぶち抜きコマ”の作成ができます。

▼この原稿のコマをぶち抜いていきます

▼「コマ枠ペン」の設定

1.コマ枠ペンを選択し、[ツールプロパティ]、
  もしくは項目がなければ[サブツール詳細]を開きます。
2.下図(1)の[枠線を描画]のチェックを外します。
3.下図(2)の[追加方法]を[選択中のフォルダーに追加]に設定します。
4.下図(3)の[コマの内側を塗りつぶす]のチェックを外します。

▼さっそくぶち抜こう!

消したい枠線があるコマレイヤーを選択し、
消したい場所を先ほど設定したコマ枠ペンで囲っていきます。
コマフォルダーで分かれている場合は消したい線ごとに
レイヤーを切り替えてください。

▼完成

コマレイヤーに新たな枠線なしのコマを追加している状態なので、
オブジェクトツールでぶち抜き部分だけを選択して[消去](Delキー押下)をすれば
元に戻すことも出来ます。

【追記】
すみません…ここまで書いておいて申し訳ないのですが、調べてみたら
既に「折れ線コマツール」を使って紹介してらっしゃる方や
https://twitter.com/i/moments/850623018715930626
設定したコマ枠ペンをASSETSで素材配布されている方がいらっしゃいました。
https://assets.clip-studio.com/ja-jp/detail?id=1693525

設定は同じとなってますので各々自分に合った方法をご選択頂ければと思います。

※上記に記載させて頂いた方々不都合でしたら削除いたしますのでDM等でお知らせ頂ければ幸いです…